Проф. Мария Попова е основател на Югоизточноевропейския център за семиотични изследвания, на Международната ранноесенна школа по семиотика и на магистърската и докторската програма по семиотика в Нов български университет. Удостоена е със званието „Почетен професор на Нов български университет“ за цялостния й принос към Нов български университет. От 2000 г. е председател на Българско семиотично дружество. Член е на изпълнителния комитет на Международната асоциация за семиотични изследвания. Публикува редица изследвания, сред които монографиите „Оценка на разбираемостта и качеството на предаваната реч по телефонни канали“, „Съпоставителна фонетика и интонация“, „Точните методи и изследването на отношението „творба – публика“, „Процесът на речевото общуване“, „Семиотика и комуникации. Очерци и разговори за знака и неговата употреба“ и др. Автор е на романите ,Ден и нощ, нощ и ден - разкази, портрети, рими“ и „Портрети на мъже“.